于月华¹ , 冯紫平¹ , 郑崇珂² , 倪志勇^1* , 邱红伟³ , 赵勇³

1新疆农业大学农学院,乌鲁木齐, 830052; 2山东省农业科学院山东省水稻研究所,济南, 250100; 3石家庄市农林科学研究院,石家庄, 050041
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2019年11月06日    接受日期: 2019年11月13日    发表日期: 2021年04月06日

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miR164 是植物特有的一类 miRNA，参与调控植物的生长发育和对逆境胁迫的响应。为深入理解Car-miR164 的功能和调控机制，本研究通过全基因组手段鉴定鹰嘴豆Car-miR164 家族成员并预测靶基因功能，在 PmiREN中获得Car-miR164 家族 5个成员的序列，通过染色体定位技术表明其位于鹰嘴豆 Ca3、Ca4和 Ca7三条染色体上。通过多序列比对发现Car-miR164 家族 5个成员的 21 bp成熟序列的一致性很高，仅在 5'端第 13、17和 21个核苷酸处存在差异。二级结构分析表明Car-miR164 家族 5个成员的前体序列都能形成稳定的茎环结构，成熟的 miRNA序列均位于 5'端。进化树分析表明水稻、拟南芥、苜蓿、大豆和鹰嘴豆中miR164 家族成员主要聚为 3个分支，Car-MIR164a 与Mtr-MIR164j 聚在一个分支，其他 4个Car-MIR164聚在另外一个分支。靶基因预测表明Car-miR164 家族 5个成员的靶基因为鹰嘴豆 NAC转录因子家族成员NAC09、NAC11 和NAC57。转录组数据分析表明在鹰嘴豆 8个不同组织中Car-miR164b/c/e 的表达量比Car-miR164a/d 高。本实验为进一步研究鹰嘴豆Car-miR164 家族成员及其靶基因提供理论依据。

鹰嘴豆；miR164；靶基因